NCMG databáze
- Databáze ke stažení:
Verze 3
vzorky: celkem 3206 vzorků (1461 mužů a 1745 žen)
Stažení v Excelovém souboru: zde -- přidáno: 24.06.2026
V případě publikování a prezentování výsledků, které byly podpořeny projektem NCMG, jsou uživatelé povinni uvést poděkování.
Jedná se o vzorky představujících běžnou populaci bez závažných onemocnění. Databáze obsahuje 707 011 variant.
Verze 2
vzorky: celkem 1799 vzorků (796 mužů a 1003 žen)
Stažení v Excelovém souboru: zde -- přidáno: 26.02.2024
V případě publikování a prezentování výsledků, které byly podpořeny projektem NCMG jsou uživatelé povinni uvést poděkování.
Verze 1
vzorky: celkem 1055 vzorků (442 mužů a 613 žen)
- 572 vzorků představujících běžnou populaci bez závažných onemocnění (neselektovana_populace)
- 483 vzorků představujících populaci starší 70 let, bez závažných onemocnění (NCMG_controls)
Stažení v Excelovém souboru: zde -- aktualizace 23. 9. 2019
V případě publikování a prezentování výsledků, které byly podpořeny projektem NCMG jsou uživatelé povinni uvést poděkování.
- Popis souboru a zpracování dat:
varianty: obsahuje všechny kódující a sestřihové varianty s populační frekvencí menší než 5 %
referenční sekvence: hg19
použité nástroje: novoalign, picard tools, GATK HaplotypeCaller, GEMINI
popisy jednotlivých sloupců jsou součástí Excelového souboru, záložka Legenda
V případě dotazů kontaktujte Viktora Stráneckého (vstra@lf1.cuni.cz) a Lenku Noskovou (lnosk@lf1.cuni.cz).